Paul Aulagnier werd op 25 mei 1943 geboren. Na zijn studie rechten aan de universiteit van Clermont-Ferrand in 1964 ging hij naar het Franstalige seminarie in Rome en hij studeerde aan de Gregoriana filosofie en theologie.
Tijdens het Tweede Vaticaans Concilie ontmoette hij Aartsbisschop Marcel Lefebvre en volgde hem in 1969 naar Freiburg, alwaar de Aartsbisschop – mede op verzoek van Aulagnier – een seminarie stichtte, dat de traditionele Priesteropleiding voor de Mis in de buitengewone vorm aanbood.